Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms