Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IGHV3-7P01780 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-7P01780 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms