Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLDN7O95471 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms