Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETM1O95202 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETM1O95202 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETM1O95202 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETM1O95202 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETM1O95202 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETM1O95202 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETM1O95202 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETM1O95202 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETM1O95202 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETM1O95202 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETM1O95202 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETM1O95202 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETM1O95202 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETM1O95202 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETM1O95202 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETM1O95202 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LETM1O95202 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETM1O95202 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETM1O95202 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETM1O95202 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETM1O95202 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETM1O95202 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETM1O95202 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETM1O95202 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETM1O95202 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETM1O95202 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETM1O95202 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETM1O95202 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETM1O95202 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETM1O95202 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETM1O95202 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETM1O95202 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETM1O95202 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETM1O95202 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETM1O95202 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETM1O95202 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LETM1O95202 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LETM1O95202 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LETM1O95202 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM1O95202 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LETM1O95202 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LETM1O95202 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM1O95202 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM1O95202 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM1O95202 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM1O95202 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM1O95202 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM1O95202 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM1O95202 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM1O95202 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM1O95202 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM1O95202 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM1O95202 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM1O95202 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM1O95202 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM1O95202 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM1O95202 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM1O95202 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM1O95202 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM1O95202 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM1O95202 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM1O95202 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM1O95202 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM1O95202 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM1O95202 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM1O95202 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM1O95202 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM1O95202 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM1O95202 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM1O95202 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM1O95202 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM1O95202 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM1O95202 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM1O95202 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms