Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UFL1O94874 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UFL1O94874 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UFL1O94874 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UFL1O94874 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UFL1O94874 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UFL1O94874 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UFL1O94874 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UFL1O94874 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UFL1O94874 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UFL1O94874 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UFL1O94874 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UFL1O94874 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UFL1O94874 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UFL1O94874 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UFL1O94874 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UFL1O94874 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UFL1O94874 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UFL1O94874 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UFL1O94874 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UFL1O94874 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UFL1O94874 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UFL1O94874 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UFL1O94874 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UFL1O94874 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UFL1O94874 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UFL1O94874 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UFL1O94874 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UFL1O94874 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UFL1O94874 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UFL1O94874 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UFL1O94874 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UFL1O94874 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UFL1O94874 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UFL1O94874 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UFL1O94874 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UFL1O94874 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UFL1O94874 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UFL1O94874 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UFL1O94874 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UFL1O94874 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UFL1O94874 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UFL1O94874 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UFL1O94874 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UFL1O94874 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UFL1O94874 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UFL1O94874 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UFL1O94874 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UFL1O94874 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UFL1O94874 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UFL1O94874 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UFL1O94874 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UFL1O94874 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UFL1O94874 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UFL1O94874 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UFL1O94874 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UFL1O94874 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UFL1O94874 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UFL1O94874 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UFL1O94874 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UFL1O94874 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UFL1O94874 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UFL1O94874 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UFL1O94874 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UFL1O94874 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UFL1O94874 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UFL1O94874 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UFL1O94874 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UFL1O94874 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UFL1O94874 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UFL1O94874 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UFL1O94874 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UFL1O94874 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UFL1O94874 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UFL1O94874 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UFL1O94874 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UFL1O94874 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UFL1O94874 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UFL1O94874 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UFL1O94874 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UFL1O94874 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UFL1O94874 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UFL1O94874 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UFL1O94874 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UFL1O94874 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UFL1O94874 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UFL1O94874 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UFL1O94874 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UFL1O94874 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UFL1O94874 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UFL1O94874 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UFL1O94874 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UFL1O94874 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UFL1O94874 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UFL1O94874 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UFL1O94874 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UFL1O94874 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UFL1O94874 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UFL1O94874 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UFL1O94874 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms