Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF3O75054 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms