Protein–RNA interactions for Protein: O60888

CUTA, Protein CutA, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTAO60888 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUTAO60888 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUTAO60888 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUTAO60888 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUTAO60888 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUTAO60888 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUTAO60888 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUTAO60888 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUTAO60888 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUTAO60888 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUTAO60888 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUTAO60888 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUTAO60888 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUTAO60888 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUTAO60888 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUTAO60888 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUTAO60888 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUTAO60888 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTAO60888 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTAO60888 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTAO60888 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTAO60888 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTAO60888 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTAO60888 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTAO60888 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTAO60888 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTAO60888 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTAO60888 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTAO60888 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTAO60888 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTAO60888 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTAO60888 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTAO60888 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTAO60888 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTAO60888 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTAO60888 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTAO60888 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTAO60888 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTAO60888 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUTAO60888 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTAO60888 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTAO60888 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTAO60888 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTAO60888 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTAO60888 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTAO60888 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTAO60888 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTAO60888 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTAO60888 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTAO60888 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTAO60888 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTAO60888 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTAO60888 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTAO60888 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTAO60888 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTAO60888 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTAO60888 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTAO60888 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUTAO60888 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CUTAO60888 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUTAO60888 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUTAO60888 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUTAO60888 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUTAO60888 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUTAO60888 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CUTAO60888 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUTAO60888 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUTAO60888 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUTAO60888 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUTAO60888 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CUTAO60888 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUTAO60888 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUTAO60888 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUTAO60888 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUTAO60888 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms