Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms