Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA5O60264 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA5O60264 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms