Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNQ3O43525 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms