Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBFA2T2O43439 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms