Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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