Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTIFO43310 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTIFO43310 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTIFO43310 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTIFO43310 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTIFO43310 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTIFO43310 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTIFO43310 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTIFO43310 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTIFO43310 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTIFO43310 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTIFO43310 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTIFO43310 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTIFO43310 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTIFO43310 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTIFO43310 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTIFO43310 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTIFO43310 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTIFO43310 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTIFO43310 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTIFO43310 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTIFO43310 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTIFO43310 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTIFO43310 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTIFO43310 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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