Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCP110O43303 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCP110O43303 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCP110O43303 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCP110O43303 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCP110O43303 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCP110O43303 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCP110O43303 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCP110O43303 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCP110O43303 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCP110O43303 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCP110O43303 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCP110O43303 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCP110O43303 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCP110O43303 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCP110O43303 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCP110O43303 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCP110O43303 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCP110O43303 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCP110O43303 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCP110O43303 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCP110O43303 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCP110O43303 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCP110O43303 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCP110O43303 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCP110O43303 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCP110O43303 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCP110O43303 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCP110O43303 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCP110O43303 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCP110O43303 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCP110O43303 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCP110O43303 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCP110O43303 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCP110O43303 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCP110O43303 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCP110O43303 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCP110O43303 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCP110O43303 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCP110O43303 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCP110O43303 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCP110O43303 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCP110O43303 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCP110O43303 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCP110O43303 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCP110O43303 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCP110O43303 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms