Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms