Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBAG9O00559 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms