Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA8SH3BPF8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA8SH3BPF8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA8SH3BPF8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA8SH3BPF8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA8SH3BPF8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA8SH3BPF8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms