Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3E7EW58 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3E7EW58 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms