Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPBD1B2RD01 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CENPBD1B2RD01 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CENPBD1B2RD01 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CENPBD1B2RD01 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPBD1B2RD01 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPBD1B2RD01 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPBD1B2RD01 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPBD1B2RD01 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPBD1B2RD01 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPBD1B2RD01 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPBD1B2RD01 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPBD1B2RD01 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPBD1B2RD01 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPBD1B2RD01 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPBD1B2RD01 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPBD1B2RD01 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms