Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VGLL3A8MV65 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VGLL3A8MV65 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VGLL3A8MV65 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VGLL3A8MV65 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VGLL3A8MV65 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VGLL3A8MV65 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VGLL3A8MV65 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VGLL3A8MV65 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VGLL3A8MV65 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VGLL3A8MV65 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VGLL3A8MV65 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VGLL3A8MV65 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VGLL3A8MV65 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms