Protein–RNA interactions for Protein: A8MRT5

NPIPB5, Nuclear pore complex-interacting protein family member B5, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB5A8MRT5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms