Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB2A8KAH6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSPB2A8KAH6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms