Protein–RNA interactions for Protein: A6NFN3

RBFOX3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX3A6NFN3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBFOX3A6NFN3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms