Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms