Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS37CA5D8V6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms