Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEFA5A3E0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms