Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC45.6■■■■■ 4.89
LAMC3Q9Y6N6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
LAMC3Q9Y6N6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC45.58■■■■■ 4.89
LAMC3Q9Y6N6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC45.57■■■■■ 4.89
LAMC3Q9Y6N6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.88
LAMC3Q9Y6N6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
LAMC3Q9Y6N6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
LAMC3Q9Y6N6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC45.55■■■■■ 4.88
LAMC3Q9Y6N6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.55■■■■■ 4.88
LAMC3Q9Y6N6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
LAMC3Q9Y6N6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
LAMC3Q9Y6N6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
LAMC3Q9Y6N6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
LAMC3Q9Y6N6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
LAMC3Q9Y6N6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
LAMC3Q9Y6N6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
LAMC3Q9Y6N6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
LAMC3Q9Y6N6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
LAMC3Q9Y6N6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC45.52■■■■■ 4.88
LAMC3Q9Y6N6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
LAMC3Q9Y6N6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
LAMC3Q9Y6N6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC45.5■■■■■ 4.87
LAMC3Q9Y6N6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
LAMC3Q9Y6N6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
LAMC3Q9Y6N6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC45.48■■■■■ 4.87
LAMC3Q9Y6N6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
LAMC3Q9Y6N6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC45.46■■■■■ 4.87
LAMC3Q9Y6N6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
LAMC3Q9Y6N6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
LAMC3Q9Y6N6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC45.45■■■■■ 4.87
LAMC3Q9Y6N6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
LAMC3Q9Y6N6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
LAMC3Q9Y6N6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC45.41■■■■■ 4.86
LAMC3Q9Y6N6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
LAMC3Q9Y6N6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
LAMC3Q9Y6N6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC45.4■■■■■ 4.86
LAMC3Q9Y6N6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC45.39■■■■■ 4.86
LAMC3Q9Y6N6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC45.38■■■■■ 4.85
LAMC3Q9Y6N6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
LAMC3Q9Y6N6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
LAMC3Q9Y6N6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
LAMC3Q9Y6N6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.35■■■■■ 4.85
LAMC3Q9Y6N6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
LAMC3Q9Y6N6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
LAMC3Q9Y6N6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
LAMC3Q9Y6N6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
LAMC3Q9Y6N6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC45.34■■■■■ 4.85
LAMC3Q9Y6N6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.34■■■■■ 4.85
LAMC3Q9Y6N6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC45.33■■■■■ 4.85
LAMC3Q9Y6N6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
LAMC3Q9Y6N6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
LAMC3Q9Y6N6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
LAMC3Q9Y6N6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
LAMC3Q9Y6N6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
LAMC3Q9Y6N6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
LAMC3Q9Y6N6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
LAMC3Q9Y6N6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.3■■■■■ 4.84
LAMC3Q9Y6N6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC45.3■■■■■ 4.84
LAMC3Q9Y6N6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC45.3■■■■■ 4.84
LAMC3Q9Y6N6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC45.3■■■■■ 4.84
LAMC3Q9Y6N6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
LAMC3Q9Y6N6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
LAMC3Q9Y6N6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC45.3■■■■■ 4.84
LAMC3Q9Y6N6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC45.29■■■■■ 4.84
LAMC3Q9Y6N6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
LAMC3Q9Y6N6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC45.29■■■■■ 4.84
LAMC3Q9Y6N6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
LAMC3Q9Y6N6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
LAMC3Q9Y6N6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC45.27■■■■■ 4.84
LAMC3Q9Y6N6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
LAMC3Q9Y6N6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
LAMC3Q9Y6N6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC45.26■■■■■ 4.84
LAMC3Q9Y6N6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC45.26■■■■■ 4.84
LAMC3Q9Y6N6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
LAMC3Q9Y6N6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
LAMC3Q9Y6N6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC45.24■■■■■ 4.83
LAMC3Q9Y6N6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
LAMC3Q9Y6N6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
LAMC3Q9Y6N6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
LAMC3Q9Y6N6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC45.24■■■■■ 4.83
LAMC3Q9Y6N6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
LAMC3Q9Y6N6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
LAMC3Q9Y6N6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
LAMC3Q9Y6N6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC45.22■■■■■ 4.83
LAMC3Q9Y6N6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
LAMC3Q9Y6N6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
LAMC3Q9Y6N6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC45.21■■■■■ 4.83
LAMC3Q9Y6N6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
LAMC3Q9Y6N6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
LAMC3Q9Y6N6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
LAMC3Q9Y6N6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
LAMC3Q9Y6N6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
LAMC3Q9Y6N6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC45.2■■■■■ 4.83
LAMC3Q9Y6N6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC45.19■■■■■ 4.82
LAMC3Q9Y6N6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC45.18■■■■■ 4.82
LAMC3Q9Y6N6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
LAMC3Q9Y6N6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
LAMC3Q9Y6N6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
LAMC3Q9Y6N6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
LAMC3Q9Y6N6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms