Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHKBQ9Y259 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHKBQ9Y259 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHKBQ9Y259 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHKBQ9Y259 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHKBQ9Y259 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHKBQ9Y259 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHKBQ9Y259 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHKBQ9Y259 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHKBQ9Y259 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHKBQ9Y259 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHKBQ9Y259 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHKBQ9Y259 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHKBQ9Y259 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHKBQ9Y259 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CHKBQ9Y259 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHKBQ9Y259 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHKBQ9Y259 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHKBQ9Y259 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHKBQ9Y259 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHKBQ9Y259 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHKBQ9Y259 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHKBQ9Y259 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHKBQ9Y259 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHKBQ9Y259 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHKBQ9Y259 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHKBQ9Y259 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHKBQ9Y259 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHKBQ9Y259 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHKBQ9Y259 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHKBQ9Y259 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHKBQ9Y259 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHKBQ9Y259 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHKBQ9Y259 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHKBQ9Y259 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CHKBQ9Y259 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHKBQ9Y259 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHKBQ9Y259 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CHKBQ9Y259 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHKBQ9Y259 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHKBQ9Y259 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHKBQ9Y259 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CHKBQ9Y259 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHKBQ9Y259 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms