Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC2Q9Y235 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC2Q9Y235 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC2Q9Y235 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC2Q9Y235 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC2Q9Y235 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC2Q9Y235 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC2Q9Y235 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC2Q9Y235 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC2Q9Y235 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC2Q9Y235 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC2Q9Y235 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC2Q9Y235 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC2Q9Y235 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC2Q9Y235 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC2Q9Y235 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC2Q9Y235 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC2Q9Y235 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC2Q9Y235 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
APOBEC2Q9Y235 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
APOBEC2Q9Y235 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC2Q9Y235 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC2Q9Y235 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC2Q9Y235 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC2Q9Y235 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC2Q9Y235 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC2Q9Y235 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC2Q9Y235 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC2Q9Y235 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC2Q9Y235 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC2Q9Y235 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC2Q9Y235 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC2Q9Y235 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC2Q9Y235 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC2Q9Y235 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC2Q9Y235 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC2Q9Y235 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC2Q9Y235 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC2Q9Y235 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC2Q9Y235 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC2Q9Y235 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC2Q9Y235 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC2Q9Y235 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOBEC2Q9Y235 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOBEC2Q9Y235 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBEC2Q9Y235 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC2Q9Y235 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC2Q9Y235 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC2Q9Y235 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC2Q9Y235 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC2Q9Y235 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC2Q9Y235 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBEC2Q9Y235 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC2Q9Y235 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC2Q9Y235 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBEC2Q9Y235 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC2Q9Y235 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBEC2Q9Y235 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms