Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
L1RE1Q9UN81 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
L1RE1Q9UN81 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
L1RE1Q9UN81 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
L1RE1Q9UN81 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
L1RE1Q9UN81 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
L1RE1Q9UN81 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
L1RE1Q9UN81 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
L1RE1Q9UN81 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
L1RE1Q9UN81 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
L1RE1Q9UN81 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
L1RE1Q9UN81 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
L1RE1Q9UN81 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
L1RE1Q9UN81 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
L1RE1Q9UN81 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
L1RE1Q9UN81 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
L1RE1Q9UN81 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
L1RE1Q9UN81 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
L1RE1Q9UN81 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
L1RE1Q9UN81 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
L1RE1Q9UN81 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
L1RE1Q9UN81 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
L1RE1Q9UN81 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
L1RE1Q9UN81 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
L1RE1Q9UN81 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
L1RE1Q9UN81 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
L1RE1Q9UN81 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
L1RE1Q9UN81 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
L1RE1Q9UN81 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
L1RE1Q9UN81 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
L1RE1Q9UN81 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
L1RE1Q9UN81 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
L1RE1Q9UN81 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
L1RE1Q9UN81 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
L1RE1Q9UN81 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
L1RE1Q9UN81 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
L1RE1Q9UN81 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
L1RE1Q9UN81 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
L1RE1Q9UN81 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
L1RE1Q9UN81 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
L1RE1Q9UN81 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
L1RE1Q9UN81 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
L1RE1Q9UN81 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
L1RE1Q9UN81 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
L1RE1Q9UN81 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
L1RE1Q9UN81 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
L1RE1Q9UN81 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
L1RE1Q9UN81 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
L1RE1Q9UN81 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
L1RE1Q9UN81 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms