Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYNRGQ9UMZ2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYNRGQ9UMZ2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYNRGQ9UMZ2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYNRGQ9UMZ2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SYNRGQ9UMZ2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNRGQ9UMZ2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNRGQ9UMZ2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNRGQ9UMZ2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNRGQ9UMZ2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNRGQ9UMZ2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNRGQ9UMZ2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYNRGQ9UMZ2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNRGQ9UMZ2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNRGQ9UMZ2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNRGQ9UMZ2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SYNRGQ9UMZ2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNRGQ9UMZ2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNRGQ9UMZ2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNRGQ9UMZ2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNRGQ9UMZ2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNRGQ9UMZ2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNRGQ9UMZ2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNRGQ9UMZ2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNRGQ9UMZ2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNRGQ9UMZ2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNRGQ9UMZ2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNRGQ9UMZ2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNRGQ9UMZ2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNRGQ9UMZ2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYNRGQ9UMZ2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYNRGQ9UMZ2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SYNRGQ9UMZ2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNRGQ9UMZ2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNRGQ9UMZ2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYNRGQ9UMZ2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYNRGQ9UMZ2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYNRGQ9UMZ2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYNRGQ9UMZ2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYNRGQ9UMZ2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYNRGQ9UMZ2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYNRGQ9UMZ2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYNRGQ9UMZ2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYNRGQ9UMZ2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYNRGQ9UMZ2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYNRGQ9UMZ2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYNRGQ9UMZ2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYNRGQ9UMZ2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SYNRGQ9UMZ2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SYNRGQ9UMZ2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNRGQ9UMZ2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNRGQ9UMZ2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNRGQ9UMZ2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNRGQ9UMZ2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNRGQ9UMZ2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNRGQ9UMZ2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNRGQ9UMZ2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNRGQ9UMZ2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNRGQ9UMZ2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNRGQ9UMZ2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNRGQ9UMZ2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNRGQ9UMZ2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNRGQ9UMZ2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNRGQ9UMZ2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNRGQ9UMZ2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNRGQ9UMZ2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYNRGQ9UMZ2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYNRGQ9UMZ2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SYNRGQ9UMZ2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms