Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRTO4Q9UKD2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRTO4Q9UKD2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms