Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK05

GDF2, Growth/differentiation factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF2Q9UK05 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDF2Q9UK05 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF2Q9UK05 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF2Q9UK05 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms