Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS18Q9P253 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VPS18Q9P253 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS18Q9P253 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS18Q9P253 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS18Q9P253 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS18Q9P253 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS18Q9P253 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS18Q9P253 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS18Q9P253 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS18Q9P253 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS18Q9P253 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS18Q9P253 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS18Q9P253 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS18Q9P253 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS18Q9P253 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VPS18Q9P253 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VPS18Q9P253 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VPS18Q9P253 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS18Q9P253 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS18Q9P253 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS18Q9P253 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS18Q9P253 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS18Q9P253 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS18Q9P253 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS18Q9P253 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS18Q9P253 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS18Q9P253 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS18Q9P253 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS18Q9P253 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VPS18Q9P253 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS18Q9P253 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS18Q9P253 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS18Q9P253 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS18Q9P253 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS18Q9P253 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS18Q9P253 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS18Q9P253 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS18Q9P253 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS18Q9P253 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS18Q9P253 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS18Q9P253 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS18Q9P253 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS18Q9P253 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS18Q9P253 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS18Q9P253 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS18Q9P253 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS18Q9P253 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS18Q9P253 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS18Q9P253 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS18Q9P253 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS18Q9P253 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS18Q9P253 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS18Q9P253 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS18Q9P253 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS18Q9P253 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
VPS18Q9P253 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS18Q9P253 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS18Q9P253 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS18Q9P253 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS18Q9P253 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS18Q9P253 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS18Q9P253 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS18Q9P253 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS18Q9P253 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS18Q9P253 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS18Q9P253 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS18Q9P253 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS18Q9P253 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS18Q9P253 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS18Q9P253 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS18Q9P253 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS18Q9P253 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS18Q9P253 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS18Q9P253 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS18Q9P253 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS18Q9P253 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS18Q9P253 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms