Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF275Q9NSD4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF275Q9NSD4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF275Q9NSD4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF275Q9NSD4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF275Q9NSD4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF275Q9NSD4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF275Q9NSD4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF275Q9NSD4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF275Q9NSD4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF275Q9NSD4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF275Q9NSD4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF275Q9NSD4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF275Q9NSD4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF275Q9NSD4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF275Q9NSD4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF275Q9NSD4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF275Q9NSD4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF275Q9NSD4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF275Q9NSD4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF275Q9NSD4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF275Q9NSD4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF275Q9NSD4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF275Q9NSD4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF275Q9NSD4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF275Q9NSD4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF275Q9NSD4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF275Q9NSD4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF275Q9NSD4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms