Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS62

THSD1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD1Q9NS62 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THSD1Q9NS62 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THSD1Q9NS62 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THSD1Q9NS62 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
THSD1Q9NS62 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THSD1Q9NS62 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
THSD1Q9NS62 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
THSD1Q9NS62 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THSD1Q9NS62 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
THSD1Q9NS62 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THSD1Q9NS62 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
THSD1Q9NS62 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THSD1Q9NS62 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THSD1Q9NS62 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
THSD1Q9NS62 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD1Q9NS62 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THSD1Q9NS62 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
THSD1Q9NS62 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THSD1Q9NS62 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
THSD1Q9NS62 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THSD1Q9NS62 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
THSD1Q9NS62 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THSD1Q9NS62 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THSD1Q9NS62 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THSD1Q9NS62 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THSD1Q9NS62 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THSD1Q9NS62 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
THSD1Q9NS62 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THSD1Q9NS62 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THSD1Q9NS62 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THSD1Q9NS62 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THSD1Q9NS62 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THSD1Q9NS62 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THSD1Q9NS62 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THSD1Q9NS62 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THSD1Q9NS62 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD1Q9NS62 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD1Q9NS62 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD1Q9NS62 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD1Q9NS62 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THSD1Q9NS62 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD1Q9NS62 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD1Q9NS62 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD1Q9NS62 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THSD1Q9NS62 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms