Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNDIG1Q9H7V2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNDIG1Q9H7V2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNDIG1Q9H7V2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNDIG1Q9H7V2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNDIG1Q9H7V2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNDIG1Q9H7V2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNDIG1Q9H7V2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNDIG1Q9H7V2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNDIG1Q9H7V2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNDIG1Q9H7V2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNDIG1Q9H7V2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNDIG1Q9H7V2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNDIG1Q9H7V2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNDIG1Q9H7V2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNDIG1Q9H7V2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNDIG1Q9H7V2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNDIG1Q9H7V2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNDIG1Q9H7V2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNDIG1Q9H7V2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNDIG1Q9H7V2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNDIG1Q9H7V2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNDIG1Q9H7V2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNDIG1Q9H7V2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNDIG1Q9H7V2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNDIG1Q9H7V2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNDIG1Q9H7V2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNDIG1Q9H7V2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNDIG1Q9H7V2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNDIG1Q9H7V2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNDIG1Q9H7V2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNDIG1Q9H7V2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNDIG1Q9H7V2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNDIG1Q9H7V2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNDIG1Q9H7V2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNDIG1Q9H7V2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNDIG1Q9H7V2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNDIG1Q9H7V2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNDIG1Q9H7V2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNDIG1Q9H7V2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNDIG1Q9H7V2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNDIG1Q9H7V2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNDIG1Q9H7V2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNDIG1Q9H7V2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNDIG1Q9H7V2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNDIG1Q9H7V2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNDIG1Q9H7V2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNDIG1Q9H7V2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNDIG1Q9H7V2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNDIG1Q9H7V2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNDIG1Q9H7V2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNDIG1Q9H7V2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNDIG1Q9H7V2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNDIG1Q9H7V2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNDIG1Q9H7V2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNDIG1Q9H7V2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNDIG1Q9H7V2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNDIG1Q9H7V2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNDIG1Q9H7V2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNDIG1Q9H7V2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNDIG1Q9H7V2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNDIG1Q9H7V2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNDIG1Q9H7V2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNDIG1Q9H7V2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNDIG1Q9H7V2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNDIG1Q9H7V2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNDIG1Q9H7V2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNDIG1Q9H7V2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNDIG1Q9H7V2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNDIG1Q9H7V2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNDIG1Q9H7V2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNDIG1Q9H7V2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNDIG1Q9H7V2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms