Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM12Q9H4Q4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM12Q9H4Q4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM12Q9H4Q4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM12Q9H4Q4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM12Q9H4Q4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM12Q9H4Q4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM12Q9H4Q4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM12Q9H4Q4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM12Q9H4Q4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM12Q9H4Q4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM12Q9H4Q4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM12Q9H4Q4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM12Q9H4Q4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM12Q9H4Q4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM12Q9H4Q4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM12Q9H4Q4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM12Q9H4Q4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM12Q9H4Q4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM12Q9H4Q4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM12Q9H4Q4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM12Q9H4Q4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM12Q9H4Q4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM12Q9H4Q4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM12Q9H4Q4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM12Q9H4Q4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM12Q9H4Q4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM12Q9H4Q4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM12Q9H4Q4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM12Q9H4Q4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PRDM12Q9H4Q4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM12Q9H4Q4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM12Q9H4Q4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM12Q9H4Q4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM12Q9H4Q4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM12Q9H4Q4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM12Q9H4Q4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM12Q9H4Q4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM12Q9H4Q4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM12Q9H4Q4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM12Q9H4Q4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM12Q9H4Q4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM12Q9H4Q4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM12Q9H4Q4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM12Q9H4Q4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRDM12Q9H4Q4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRDM12Q9H4Q4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM12Q9H4Q4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM12Q9H4Q4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM12Q9H4Q4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM12Q9H4Q4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM12Q9H4Q4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM12Q9H4Q4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM12Q9H4Q4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM12Q9H4Q4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM12Q9H4Q4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM12Q9H4Q4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM12Q9H4Q4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM12Q9H4Q4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM12Q9H4Q4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM12Q9H4Q4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM12Q9H4Q4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM12Q9H4Q4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM12Q9H4Q4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM12Q9H4Q4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM12Q9H4Q4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM12Q9H4Q4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM12Q9H4Q4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM12Q9H4Q4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM12Q9H4Q4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM12Q9H4Q4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM12Q9H4Q4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM12Q9H4Q4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM12Q9H4Q4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM12Q9H4Q4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM12Q9H4Q4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM12Q9H4Q4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM12Q9H4Q4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM12Q9H4Q4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM12Q9H4Q4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM12Q9H4Q4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM12Q9H4Q4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM12Q9H4Q4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM12Q9H4Q4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM12Q9H4Q4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM12Q9H4Q4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM12Q9H4Q4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM12Q9H4Q4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM12Q9H4Q4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM12Q9H4Q4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM12Q9H4Q4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM12Q9H4Q4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM12Q9H4Q4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM12Q9H4Q4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM12Q9H4Q4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM12Q9H4Q4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM12Q9H4Q4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms