Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PDCL3Q9H2J4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDCL3Q9H2J4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDCL3Q9H2J4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDCL3Q9H2J4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDCL3Q9H2J4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDCL3Q9H2J4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDCL3Q9H2J4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDCL3Q9H2J4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDCL3Q9H2J4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDCL3Q9H2J4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDCL3Q9H2J4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDCL3Q9H2J4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PDCL3Q9H2J4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDCL3Q9H2J4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PDCL3Q9H2J4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PDCL3Q9H2J4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDCL3Q9H2J4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDCL3Q9H2J4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDCL3Q9H2J4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDCL3Q9H2J4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDCL3Q9H2J4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDCL3Q9H2J4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDCL3Q9H2J4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDCL3Q9H2J4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDCL3Q9H2J4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDCL3Q9H2J4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDCL3Q9H2J4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDCL3Q9H2J4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDCL3Q9H2J4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDCL3Q9H2J4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDCL3Q9H2J4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDCL3Q9H2J4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDCL3Q9H2J4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDCL3Q9H2J4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDCL3Q9H2J4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDCL3Q9H2J4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDCL3Q9H2J4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDCL3Q9H2J4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDCL3Q9H2J4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDCL3Q9H2J4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDCL3Q9H2J4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDCL3Q9H2J4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDCL3Q9H2J4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDCL3Q9H2J4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDCL3Q9H2J4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDCL3Q9H2J4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCL3Q9H2J4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCL3Q9H2J4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCL3Q9H2J4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCL3Q9H2J4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCL3Q9H2J4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCL3Q9H2J4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCL3Q9H2J4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms