Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHARPINQ9H0F6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHARPINQ9H0F6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms