Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PDGFDQ9GZP0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PDGFDQ9GZP0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PDGFDQ9GZP0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PDGFDQ9GZP0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
PDGFDQ9GZP0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PDGFDQ9GZP0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PDGFDQ9GZP0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PDGFDQ9GZP0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PDGFDQ9GZP0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PDGFDQ9GZP0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PDGFDQ9GZP0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PDGFDQ9GZP0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PDGFDQ9GZP0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PDGFDQ9GZP0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PDGFDQ9GZP0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PDGFDQ9GZP0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PDGFDQ9GZP0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PDGFDQ9GZP0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PDGFDQ9GZP0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PDGFDQ9GZP0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PDGFDQ9GZP0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PDGFDQ9GZP0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PDGFDQ9GZP0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDGFDQ9GZP0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDGFDQ9GZP0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDGFDQ9GZP0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PDGFDQ9GZP0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PDGFDQ9GZP0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PDGFDQ9GZP0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PDGFDQ9GZP0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PDGFDQ9GZP0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PDGFDQ9GZP0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PDGFDQ9GZP0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
PDGFDQ9GZP0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PDGFDQ9GZP0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PDGFDQ9GZP0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PDGFDQ9GZP0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PDGFDQ9GZP0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
PDGFDQ9GZP0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PDGFDQ9GZP0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
PDGFDQ9GZP0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PDGFDQ9GZP0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PDGFDQ9GZP0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PDGFDQ9GZP0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PDGFDQ9GZP0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PDGFDQ9GZP0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PDGFDQ9GZP0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PDGFDQ9GZP0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PDGFDQ9GZP0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PDGFDQ9GZP0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33■■■□□ 2.87
PDGFDQ9GZP0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PDGFDQ9GZP0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PDGFDQ9GZP0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PDGFDQ9GZP0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PDGFDQ9GZP0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PDGFDQ9GZP0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PDGFDQ9GZP0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PDGFDQ9GZP0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PDGFDQ9GZP0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PDGFDQ9GZP0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PDGFDQ9GZP0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PDGFDQ9GZP0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PDGFDQ9GZP0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PDGFDQ9GZP0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PDGFDQ9GZP0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
PDGFDQ9GZP0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
PDGFDQ9GZP0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
PDGFDQ9GZP0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PDGFDQ9GZP0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PDGFDQ9GZP0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PDGFDQ9GZP0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PDGFDQ9GZP0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PDGFDQ9GZP0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
PDGFDQ9GZP0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms