Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp13a2Q9CTG6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp13a2Q9CTG6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp13a2Q9CTG6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp13a2Q9CTG6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp13a2Q9CTG6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp13a2Q9CTG6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a2Q9CTG6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a2Q9CTG6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a2Q9CTG6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a2Q9CTG6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a2Q9CTG6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a2Q9CTG6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a2Q9CTG6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a2Q9CTG6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a2Q9CTG6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a2Q9CTG6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a2Q9CTG6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a2Q9CTG6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a2Q9CTG6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a2Q9CTG6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a2Q9CTG6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a2Q9CTG6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp13a2Q9CTG6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a2Q9CTG6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a2Q9CTG6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a2Q9CTG6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a2Q9CTG6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a2Q9CTG6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a2Q9CTG6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a2Q9CTG6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a2Q9CTG6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a2Q9CTG6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a2Q9CTG6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a2Q9CTG6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a2Q9CTG6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a2Q9CTG6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a2Q9CTG6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a2Q9CTG6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a2Q9CTG6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a2Q9CTG6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a2Q9CTG6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a2Q9CTG6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp13a2Q9CTG6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a2Q9CTG6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a2Q9CTG6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a2Q9CTG6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a2Q9CTG6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a2Q9CTG6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a2Q9CTG6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a2Q9CTG6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a2Q9CTG6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a2Q9CTG6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a2Q9CTG6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a2Q9CTG6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a2Q9CTG6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a2Q9CTG6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a2Q9CTG6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a2Q9CTG6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a2Q9CTG6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a2Q9CTG6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a2Q9CTG6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a2Q9CTG6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a2Q9CTG6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a2Q9CTG6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a2Q9CTG6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a2Q9CTG6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a2Q9CTG6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a2Q9CTG6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a2Q9CTG6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a2Q9CTG6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a2Q9CTG6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms