RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000038107.8

Cited2-201, Transcript of Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cited2, Length 1,979 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2-201ENSMUST00000038107 NischQ80TM9 1593 aa47,12■■■■■ 5,13
Cited2-201ENSMUST00000038107 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa46,78■■■■■ 5,08
Cited2-201ENSMUST00000038107 Abcc9P70170 1546 aa45,79■■■■■ 4,92
Cited2-201ENSMUST00000038107 Abcc8B2RUS7 1588 aa44,95■■■■■ 4,79
Cited2-201ENSMUST00000038107 Rhox8Q6VSS7 320 aa42,79■■■■■ 4,44
Cited2-201ENSMUST00000038107 ScribQ80U72 1612 aa42,2■■■■■ 4,35
Cited2-201ENSMUST00000038107 Rtl1Q7M732 1744 aa41,96■■■■■ 4,31
Cited2-201ENSMUST00000038107 Dcaf1Q80TR8 1506 aa41,91■■■■■ 4,3
Cited2-201ENSMUST00000038107 Kdm5dQ62240 1548 aa41,28■■■■■ 4,2
Cited2-201ENSMUST00000038107 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa41,25■■■■■ 4,19
Cited2-201ENSMUST00000038107 NacadQ5SWP3 1504 aa41,07■■■■■ 4,16
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ccdc180J3QNE4 1664 aa40,98■■■■■ 4,15
Cited2-201ENSMUST00000038107 Baz1aO88379 1555 aa40,78■■■■■ 4,12
Cited2-201ENSMUST00000038107 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP40,57■■■■■ 4,09
Cited2-201ENSMUST00000038107 Crybg2B7ZCC2 1516 aa40,21■■■■■ 4,03
Cited2-201ENSMUST00000038107 Sycp2Q9CUU3 1500 aa40,19■■■■■ 4,02
Cited2-201ENSMUST00000038107 Smarca2Q6DIC0 1577 aa39,81■■■■□ 3,96
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa39,73■■■■□ 3,95
Cited2-201ENSMUST00000038107 BicraF8VPZ9 1578 aa39,36■■■■□ 3,89
Cited2-201ENSMUST00000038107 Trim41Q5NCC3 630 aa39,1■■■■□ 3,85
Cited2-201ENSMUST00000038107 HrcG5E8J6 738 aa39,07■■■■□ 3,84
Cited2-201ENSMUST00000038107 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa38,92■■■■□ 3,82
Cited2-201ENSMUST00000038107 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP38,78■■■■□ 3,8
Cited2-201ENSMUST00000038107 Synj1Q8CHC4 1574 aa38,53■■■■□ 3,76
Cited2-201ENSMUST00000038107 CftrP26361 1476 aa38,35■■■■□ 3,73
Cited2-201ENSMUST00000038107 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP38,33■■■■□ 3,73
Cited2-201ENSMUST00000038107 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa38,24■■■■□ 3,71
Cited2-201ENSMUST00000038107 Golga3P55937 1487 aa38,18■■■■□ 3,7
Cited2-201ENSMUST00000038107 Cep164Q5DU05 1446 aa38,17■■■■□ 3,7
Cited2-201ENSMUST00000038107 Cngb1E1AZ71 1325 aa38,1■■■■□ 3,69
Cited2-201ENSMUST00000038107 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP38■■■■□ 3,67
Cited2-201ENSMUST00000038107 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP37,91■■■■□ 3,66
Cited2-201ENSMUST00000038107 Top2bQ64511 1612 aa37,88■■■■□ 3,65
Cited2-201ENSMUST00000038107 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP37,87■■■■□ 3,65
Cited2-201ENSMUST00000038107 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP37,87■■■■□ 3,65
Cited2-201ENSMUST00000038107 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa37,86■■■■□ 3,65
Cited2-201ENSMUST00000038107 Chic1Q8CBW7 227 aa37,77■■■■□ 3,64
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa37,75■■■■□ 3,63
Cited2-201ENSMUST00000038107 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa37,48■■■■□ 3,59
Cited2-201ENSMUST00000038107 Fmn1Q05860 1466 aa37,32■■■■□ 3,56
Cited2-201ENSMUST00000038107 Gab3Q8BSM5 595 aa37,26■■■■□ 3,55
Cited2-201ENSMUST00000038107 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP37,25■■■■□ 3,55
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP37,24■■■■□ 3,55
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ercc6F8VPZ5 1481 aa37,23■■■■□ 3,55
Cited2-201ENSMUST00000038107 Wdr62Q3U3T8 1523 aa37,2■■■■□ 3,55
Cited2-201ENSMUST00000038107 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa37,2■■■■□ 3,55
Cited2-201ENSMUST00000038107 Frmpd1A2AKB4 1549 aa37,17■■■■□ 3,54
Cited2-201ENSMUST00000038107 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP37,05■■■■□ 3,52
Cited2-201ENSMUST00000038107 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP37,04■■■■□ 3,52
Cited2-201ENSMUST00000038107 TnnQ80Z71 1560 aa36,94■■■■□ 3,5
Cited2-201ENSMUST00000038107 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa36,8■■■■□ 3,48
Cited2-201ENSMUST00000038107 Unc13aQ4KUS2 1712 aa36,79■■■■□ 3,48
Cited2-201ENSMUST00000038107 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa36,79■■■■□ 3,48
Cited2-201ENSMUST00000038107 Lamc3Q9R0B6 1581 aa36,74■■■■□ 3,47
Cited2-201ENSMUST00000038107 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP36,65■■■■□ 3,46
Cited2-201ENSMUST00000038107 Fam135aQ6NS59 1506 aa36,62■■■■□ 3,45
Cited2-201ENSMUST00000038107 Kif15Q6P9L6 1387 aa36,53■■■■□ 3,44
Cited2-201ENSMUST00000038107 Cep162Q6ZQ06 1403 aa36,46■■■■□ 3,43
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ubl4bQ9CQ84 188 aa36,35■■■■□ 3,41
Cited2-201ENSMUST00000038107 Camsap1A2AHC3 1581 aa36,35■■■■□ 3,41
Cited2-201ENSMUST00000038107 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP36,32■■■■□ 3,41
Cited2-201ENSMUST00000038107 Npm2Q80W85 207 aa36,26■■■■□ 3,4
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ccdc18Q640L5 1455 aa36,18■■■■□ 3,38
Cited2-201ENSMUST00000038107 NrkQ9R0G8 1455 aa36,15■■■■□ 3,38
Cited2-201ENSMUST00000038107 Il27Q8K3I6 234 aa36,15■■■■□ 3,38
Cited2-201ENSMUST00000038107 PtprkP35822 1457 aa36,14■■■■□ 3,38
Cited2-201ENSMUST00000038107 Myt1lP97500 1187 aa36,09■■■■□ 3,37
Cited2-201ENSMUST00000038107 Baz1bQ9Z277 1479 aa36,09■■■■□ 3,37
Cited2-201ENSMUST00000038107 Shroom4Q1W617 1475 aa36,08■■■■□ 3,37
Cited2-201ENSMUST00000038107 Cux2P70298 1426 aa36,04■■■■□ 3,36
Cited2-201ENSMUST00000038107 Grin2bQ01097 1482 aa36,04■■■■□ 3,36
Cited2-201ENSMUST00000038107 Arhgap35Q91YM2 1499 aa36,04■■■■□ 3,36
Cited2-201ENSMUST00000038107 Map3k1P53349 1493 aa35,85■■■■□ 3,33
Cited2-201ENSMUST00000038107 Mrc2Q64449 1479 aa35,81■■■■□ 3,32
Cited2-201ENSMUST00000038107 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP35,8■■■■□ 3,32
Cited2-201ENSMUST00000038107 Clip1Q922J3 1391 aa35,76■■■■□ 3,32
Cited2-201ENSMUST00000038107 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP35,7■■■■□ 3,31
Cited2-201ENSMUST00000038107 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa35,69■■■■□ 3,3
Cited2-201ENSMUST00000038107 Mier1Q5UAK0 511 aa35,69■■■■□ 3,3
Cited2-201ENSMUST00000038107 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP35,65■■■■□ 3,3
Cited2-201ENSMUST00000038107 Efcab5A0JP43 1406 aa35,64■■■■□ 3,3
Cited2-201ENSMUST00000038107 Eea1Q8BL66 1411 aa35,57■■■■□ 3,28
Cited2-201ENSMUST00000038107 Duox2A2AQ99 1517 aa35,56■■■■□ 3,28
Cited2-201ENSMUST00000038107 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP35,56■■■■□ 3,28
Cited2-201ENSMUST00000038107 UbtfP25976 765 aaKnown RBP35,55■■■■□ 3,28
Cited2-201ENSMUST00000038107 Zeb1Q64318 1117 aa35,55■■■■□ 3,28
Cited2-201ENSMUST00000038107 Arap1Q4LDD4 1452 aa35,49■■■■□ 3,27
Cited2-201ENSMUST00000038107 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP35,43■■■■□ 3,26
Cited2-201ENSMUST00000038107 Setd5Q5XJV7 1441 aa35,42■■■■□ 3,26
Cited2-201ENSMUST00000038107 NefmP08553 848 aa35,42■■■■□ 3,26
Cited2-201ENSMUST00000038107 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa35,39■■■■□ 3,26
Cited2-201ENSMUST00000038107 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa35,38■■■■□ 3,25
Cited2-201ENSMUST00000038107 Kif21aQ9QXL2 1672 aa35,37■■■■□ 3,25
Cited2-201ENSMUST00000038107 Erich3F6QRE9 1637 aa35,37■■■■□ 3,25
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ankrd26Q811D2 1581 aa35,35■■■■□ 3,25
Cited2-201ENSMUST00000038107 Samd9lQ69Z37 1561 aa35,34■■■■□ 3,25
Cited2-201ENSMUST00000038107 Carmil1Q6EDY6 1374 aa35,32■■■■□ 3,25
Cited2-201ENSMUST00000038107 Crocc2F6XLV1 1638 aa35,28■■■■□ 3,24
Cited2-201ENSMUST00000038107 SynmQ70IV5 1561 aa35,28■■■■□ 3,24
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa35,2■■■■□ 3,22
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10,4 ms