RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000210430.1

Gm45580-201, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Gm45580, Length 889 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa50,63■■■■■ 5,7
Gm45580-201ENSMUST00000210430 NischQ80TM9 1593 aa50,26■■■■■ 5,64
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Abcc9P70170 1546 aa49,38■■■■■ 5,5
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Abcc8B2RUS7 1588 aa48,22■■■■■ 5,31
Gm45580-201ENSMUST00000210430 ScribQ80U72 1612 aa47,3■■■■■ 5,16
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa46,68■■■■■ 5,06
Gm45580-201ENSMUST00000210430 NacadQ5SWP3 1504 aa45,49■■■■■ 4,87
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Kdm5dQ62240 1548 aa45,3■■■■■ 4,84
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Dcaf1Q80TR8 1506 aa44,96■■■■■ 4,79
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Sycp2Q9CUU3 1500 aa44,72■■■■■ 4,75
Gm45580-201ENSMUST00000210430 BicraF8VPZ9 1578 aa44,48■■■■■ 4,71
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Rhox8Q6VSS7 320 aa44,32■■■■■ 4,69
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Dnajc5P60904 198 aa44,03■■■■■ 4,64
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa43,95■■■■■ 4,63
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP43,94■■■■■ 4,62
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Ccdc180J3QNE4 1664 aa43,93■■■■■ 4,62
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP43,61■■■■■ 4,57
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Baz1aO88379 1555 aa43,46■■■■■ 4,55
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa43,31■■■■■ 4,52
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Crybg2B7ZCC2 1516 aa43,17■■■■■ 4,5
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Trim41Q5NCC3 630 aa43,15■■■■■ 4,5
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Rtl1Q7M732 1744 aa43,14■■■■■ 4,5
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP42,77■■■■■ 4,44
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Ercc6F8VPZ5 1481 aa42,7■■■■■ 4,43
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Fam135aQ6NS59 1506 aa42,51■■■■■ 4,39
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP42,4■■■■■ 4,38
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Smarca2Q6DIC0 1577 aa42,31■■■■■ 4,36
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP41,93■■■■■ 4,3
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Ubl4bQ9CQ84 188 aa41,93■■■■■ 4,3
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa41,76■■■■■ 4,27
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Frmpd1A2AKB4 1549 aa41,7■■■■■ 4,27
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Wdr62Q3U3T8 1523 aa41,67■■■■■ 4,26
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Mrc2Q64449 1479 aa41,65■■■■■ 4,26
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP41,64■■■■■ 4,26
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Baz1bQ9Z277 1479 aa41,6■■■■■ 4,25
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa41,41■■■■■ 4,22
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa41,19■■■■■ 4,18
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP41,15■■■■■ 4,18
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Unc13aQ4KUS2 1712 aa40,96■■■■■ 4,15
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa40,94■■■■■ 4,14
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa40,9■■■■■ 4,14
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Synj1Q8CHC4 1574 aa40,88■■■■■ 4,13
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Col17a1Q07563 1470 aa40,83■■■■■ 4,13
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Shroom2A2ALU4 1481 aa40,83■■■■■ 4,13
Gm45580-201ENSMUST00000210430 CftrP26361 1476 aa40,83■■■■■ 4,13
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP40,76■■■■■ 4,12
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP40,38■■■■■ 4,05
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa40,28■■■■■ 4,04
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP40,19■■■■■ 4,02
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP40,15■■■■■ 4,02
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Kif21aQ9QXL2 1672 aa40,15■■■■■ 4,02
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Top2bQ64511 1612 aa40,11■■■■■ 4,01
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Golga3P55937 1487 aa40,1■■■■■ 4,01
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Cux2P70298 1426 aa40,09■■■■■ 4,01
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP40■■■■□ 3,99
Gm45580-201ENSMUST00000210430 HrcG5E8J6 738 aa39,73■■■■□ 3,95
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Kif15Q6P9L6 1387 aa39,72■■■■□ 3,95
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Cngb1E1AZ71 1325 aa39,67■■■■□ 3,94
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP39,66■■■■□ 3,94
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP39,63■■■■□ 3,93
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP39,56■■■■□ 3,92
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa39,56■■■■□ 3,92
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Plb1Q3TTY0 1478 aa39,5■■■■□ 3,91
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa39,5■■■■□ 3,91
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Lamc3Q9R0B6 1581 aa39,47■■■■□ 3,91
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Fmn1Q05860 1466 aa39,46■■■■□ 3,91
Gm45580-201ENSMUST00000210430 TnnQ80Z71 1560 aa39,45■■■■□ 3,91
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Cep164Q5DU05 1446 aa39,2■■■■□ 3,87
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa39,18■■■■□ 3,86
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Adgrl3Q80TS3 1537 aa39,14■■■■□ 3,86
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP39,09■■■■□ 3,85
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Rusc2Q80U22 1514 aa39,01■■■■□ 3,84
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Il27Q8K3I6 234 aa39■■■■□ 3,83
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP38,96■■■■□ 3,83
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Chic1Q8CBW7 227 aa38,91■■■■□ 3,82
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Camsap1A2AHC3 1581 aa38,87■■■■□ 3,81
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Gm156Q58A37 223 aa38,86■■■■□ 3,81
Gm45580-201ENSMUST00000210430 PtprtQ99M80 1454 aa38,85■■■■□ 3,81
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa38,84■■■■□ 3,81
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Ccdc18Q640L5 1455 aa38,83■■■■□ 3,81
Gm45580-201ENSMUST00000210430 PtprkP35822 1457 aa38,79■■■■□ 3,8
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Crocc2F6XLV1 1638 aa38,75■■■■□ 3,79
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Ift140E9PY46 1464 aa38,72■■■■□ 3,79
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Cep170Q6A065 1588 aa38,65■■■■□ 3,78
Gm45580-201ENSMUST00000210430 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP38,62■■■■□ 3,77
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa38,54■■■■□ 3,76
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Grin2bQ01097 1482 aa38,4■■■■□ 3,74
Gm45580-201ENSMUST00000210430 NrkQ9R0G8 1455 aa38,36■■■■□ 3,73
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Pprc1Q6NZN1 1644 aa38,3■■■■□ 3,72
Gm45580-201ENSMUST00000210430 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP38,25■■■■□ 3,71
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Disp1Q3TDN0 1521 aa38,24■■■■□ 3,71
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa38,24■■■■□ 3,71
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa38,21■■■■□ 3,71
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Shroom4Q1W617 1475 aa38,21■■■■□ 3,71
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Fgd6Q69ZL1 1399 aa38,12■■■■□ 3,69
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Gab3Q8BSM5 595 aa38,12■■■■□ 3,69
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Efcab5A0JP43 1406 aa38,11■■■■□ 3,69
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa38,09■■■■□ 3,69
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Duox2A2AQ99 1517 aa38,08■■■■□ 3,69
Gm45580-201ENSMUST00000210430 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP38,02■■■■□ 3,68
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9,2 ms