RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000114296.7

Stradb-202, Transcript of STE20-related kinase adapter protein beta, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Stradb, Length 1,348 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stradb-202ENSMUST00000114296 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa56,9■■■■■ 6,7
Stradb-202ENSMUST00000114296 NischQ80TM9 1593 aa55,65■■■■■ 6,5
Stradb-202ENSMUST00000114296 Abcc8B2RUS7 1588 aa54,12■■■■■ 6,25
Stradb-202ENSMUST00000114296 Abcc9P70170 1546 aa54,1■■■■■ 6,25
Stradb-202ENSMUST00000114296 ScribQ80U72 1612 aa52,91■■■■■ 6,06
Stradb-202ENSMUST00000114296 NacadQ5SWP3 1504 aa50,97■■■■■ 5,75
Stradb-202ENSMUST00000114296 Kdm5dQ62240 1548 aa50,85■■■■■ 5,73
Stradb-202ENSMUST00000114296 Sycp2Q9CUU3 1500 aa50,05■■■■■ 5,6
Stradb-202ENSMUST00000114296 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa49,82■■■■■ 5,57
Stradb-202ENSMUST00000114296 BicraF8VPZ9 1578 aa49,61■■■■■ 5,53
Stradb-202ENSMUST00000114296 Dcaf1Q80TR8 1506 aa49,55■■■■■ 5,52
Stradb-202ENSMUST00000114296 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa48,44■■■■■ 5,35
Stradb-202ENSMUST00000114296 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP48,43■■■■■ 5,34
Stradb-202ENSMUST00000114296 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP48,31■■■■■ 5,32
Stradb-202ENSMUST00000114296 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP47,64■■■■■ 5,22
Stradb-202ENSMUST00000114296 Baz1aO88379 1555 aa47,64■■■■■ 5,22
Stradb-202ENSMUST00000114296 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa47,6■■■■■ 5,21
Stradb-202ENSMUST00000114296 Crybg2B7ZCC2 1516 aa47,55■■■■■ 5,2
Stradb-202ENSMUST00000114296 Ccdc180J3QNE4 1664 aa47,48■■■■■ 5,19
Stradb-202ENSMUST00000114296 Ercc6F8VPZ5 1481 aa47,29■■■■■ 5,16
Stradb-202ENSMUST00000114296 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP47,13■■■■■ 5,14
Stradb-202ENSMUST00000114296 Fam135aQ6NS59 1506 aa47,06■■■■■ 5,12
Stradb-202ENSMUST00000114296 Smarca2Q6DIC0 1577 aa47,05■■■■■ 5,12
Stradb-202ENSMUST00000114296 Rhox8Q6VSS7 320 aa46,96■■■■■ 5,11
Stradb-202ENSMUST00000114296 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP46,9■■■■■ 5,1
Stradb-202ENSMUST00000114296 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa46,82■■■■■ 5,09
Stradb-202ENSMUST00000114296 Wdr62Q3U3T8 1523 aa46,58■■■■■ 5,05
Stradb-202ENSMUST00000114296 Frmpd1A2AKB4 1549 aa46,51■■■■■ 5,04
Stradb-202ENSMUST00000114296 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa46,48■■■■■ 5,03
Stradb-202ENSMUST00000114296 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP46,43■■■■■ 5,02
Stradb-202ENSMUST00000114296 Baz1bQ9Z277 1479 aa46,38■■■■■ 5,02
Stradb-202ENSMUST00000114296 Dnajc5P60904 198 aa46,06■■■■■ 4,96
Stradb-202ENSMUST00000114296 Ubl4bQ9CQ84 188 aa46,05■■■■■ 4,96
Stradb-202ENSMUST00000114296 Unc13aQ4KUS2 1712 aa45,97■■■■■ 4,95
Stradb-202ENSMUST00000114296 Mrc2Q64449 1479 aa45,94■■■■■ 4,94
Stradb-202ENSMUST00000114296 Trim41Q5NCC3 630 aa45,62■■■■■ 4,89
Stradb-202ENSMUST00000114296 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa45,19■■■■■ 4,83
Stradb-202ENSMUST00000114296 CftrP26361 1476 aa45,18■■■■■ 4,82
Stradb-202ENSMUST00000114296 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa45,11■■■■■ 4,81
Stradb-202ENSMUST00000114296 Synj1Q8CHC4 1574 aa45,02■■■■■ 4,8
Stradb-202ENSMUST00000114296 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP44,81■■■■■ 4,76
Stradb-202ENSMUST00000114296 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP44,69■■■■■ 4,75
Stradb-202ENSMUST00000114296 Kif21aQ9QXL2 1672 aa44,68■■■■■ 4,74
Stradb-202ENSMUST00000114296 Cux2P70298 1426 aa44,68■■■■■ 4,74
Stradb-202ENSMUST00000114296 Rtl1Q7M732 1744 aa44,57■■■■■ 4,73
Stradb-202ENSMUST00000114296 Kif15Q6P9L6 1387 aa44,45■■■■■ 4,71
Stradb-202ENSMUST00000114296 Shroom2A2ALU4 1481 aa44,43■■■■■ 4,7
Stradb-202ENSMUST00000114296 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP44,42■■■■■ 4,7
Stradb-202ENSMUST00000114296 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP44,25■■■■■ 4,67
Stradb-202ENSMUST00000114296 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa44,19■■■■■ 4,66
Stradb-202ENSMUST00000114296 Lamc3Q9R0B6 1581 aa44,11■■■■■ 4,65
Stradb-202ENSMUST00000114296 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP44,06■■■■■ 4,64
Stradb-202ENSMUST00000114296 Col17a1Q07563 1470 aa44,05■■■■■ 4,64
Stradb-202ENSMUST00000114296 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP43,88■■■■■ 4,61
Stradb-202ENSMUST00000114296 Cep164Q5DU05 1446 aa43,87■■■■■ 4,61
Stradb-202ENSMUST00000114296 Top2bQ64511 1612 aa43,77■■■■■ 4,6
Stradb-202ENSMUST00000114296 Plb1Q3TTY0 1478 aa43,74■■■■■ 4,59
Stradb-202ENSMUST00000114296 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP43,73■■■■■ 4,59
Stradb-202ENSMUST00000114296 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP43,65■■■■■ 4,58
Stradb-202ENSMUST00000114296 Crocc2F6XLV1 1638 aa43,49■■■■■ 4,55
Stradb-202ENSMUST00000114296 Ccdc18Q640L5 1455 aa43,42■■■■■ 4,54
Stradb-202ENSMUST00000114296 Il27Q8K3I6 234 aa43,41■■■■■ 4,54
Stradb-202ENSMUST00000114296 Rusc2Q80U22 1514 aa43,39■■■■■ 4,54
Stradb-202ENSMUST00000114296 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP43,38■■■■■ 4,54
Stradb-202ENSMUST00000114296 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP43,38■■■■■ 4,53
Stradb-202ENSMUST00000114296 TnnQ80Z71 1560 aa43,33■■■■■ 4,53
Stradb-202ENSMUST00000114296 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP43,32■■■■■ 4,53
Stradb-202ENSMUST00000114296 Ift140E9PY46 1464 aa43,24■■■■■ 4,51
Stradb-202ENSMUST00000114296 Camsap1A2AHC3 1581 aa43,23■■■■■ 4,51
Stradb-202ENSMUST00000114296 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP43,06■■■■■ 4,48
Stradb-202ENSMUST00000114296 Duox2A2AQ99 1517 aa42,84■■■■■ 4,45
Stradb-202ENSMUST00000114296 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa42,83■■■■■ 4,45
Stradb-202ENSMUST00000114296 Disp1Q3TDN0 1521 aa42,82■■■■■ 4,44
Stradb-202ENSMUST00000114296 Setd1bQ8CFT2 1985 aa42,79■■■■■ 4,44
Stradb-202ENSMUST00000114296 Golga3P55937 1487 aa42,77■■■■■ 4,44
Stradb-202ENSMUST00000114296 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa42,75■■■■■ 4,43
Stradb-202ENSMUST00000114296 Adgrl3Q80TS3 1537 aa42,7■■■■■ 4,43
Stradb-202ENSMUST00000114296 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP42,64■■■■■ 4,42
Stradb-202ENSMUST00000114296 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP42,64■■■■■ 4,42
Stradb-202ENSMUST00000114296 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa42,61■■■■■ 4,41
Stradb-202ENSMUST00000114296 Cngb1E1AZ71 1325 aa42,6■■■■■ 4,41
Stradb-202ENSMUST00000114296 Samd9lQ69Z37 1561 aa42,57■■■■■ 4,41
Stradb-202ENSMUST00000114296 Grin2bQ01097 1482 aa42,51■■■■■ 4,4
Stradb-202ENSMUST00000114296 Fmn1Q05860 1466 aa42,51■■■■■ 4,4
Stradb-202ENSMUST00000114296 Cep170Q6A065 1588 aa42,51■■■■■ 4,4
Stradb-202ENSMUST00000114296 PtprkP35822 1457 aa42,5■■■■■ 4,39
Stradb-202ENSMUST00000114296 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa42,49■■■■■ 4,39
Stradb-202ENSMUST00000114296 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa42,4■■■■■ 4,38
Stradb-202ENSMUST00000114296 Gm156Q58A37 223 aa42,39■■■■■ 4,38
Stradb-202ENSMUST00000114296 PtprtQ99M80 1454 aa42,35■■■■■ 4,37
Stradb-202ENSMUST00000114296 Fgd6Q69ZL1 1399 aa42,32■■■■■ 4,37
Stradb-202ENSMUST00000114296 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP42,29■■■■■ 4,36
Stradb-202ENSMUST00000114296 Rad54l2Q99NG0 1466 aa42,25■■■■■ 4,35
Stradb-202ENSMUST00000114296 Efcab5A0JP43 1406 aa42,23■■■■■ 4,35
Stradb-202ENSMUST00000114296 Grin2aP35436 1464 aa42,22■■■■■ 4,35
Stradb-202ENSMUST00000114296 Magi3Q9EQJ9 1476 aa42,19■■■■■ 4,34
Stradb-202ENSMUST00000114296 Abcc1O35379 1528 aa42,06■■■■■ 4,32
Stradb-202ENSMUST00000114296 Pprc1Q6NZN1 1644 aa42,05■■■■■ 4,32
Stradb-202ENSMUST00000114296 AknaQ80VW7 1404 aa42,04■■■■■ 4,32
Stradb-202ENSMUST00000114296 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP41,96■■■■■ 4,31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9,9 ms