Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBE2OQ9C0C9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBE2OQ9C0C9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
UBE2OQ9C0C9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBE2OQ9C0C9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBE2OQ9C0C9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE2OQ9C0C9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBE2OQ9C0C9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBE2OQ9C0C9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBE2OQ9C0C9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBE2OQ9C0C9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBE2OQ9C0C9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBE2OQ9C0C9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
UBE2OQ9C0C9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE2OQ9C0C9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE2OQ9C0C9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE2OQ9C0C9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE2OQ9C0C9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBE2OQ9C0C9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE2OQ9C0C9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBE2OQ9C0C9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBE2OQ9C0C9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBE2OQ9C0C9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBE2OQ9C0C9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBE2OQ9C0C9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
UBE2OQ9C0C9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE2OQ9C0C9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE2OQ9C0C9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE2OQ9C0C9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE2OQ9C0C9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBE2OQ9C0C9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBE2OQ9C0C9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBE2OQ9C0C9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBE2OQ9C0C9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBE2OQ9C0C9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
UBE2OQ9C0C9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
UBE2OQ9C0C9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBE2OQ9C0C9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBE2OQ9C0C9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBE2OQ9C0C9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBE2OQ9C0C9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE2OQ9C0C9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE2OQ9C0C9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE2OQ9C0C9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE2OQ9C0C9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE2OQ9C0C9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBE2OQ9C0C9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBE2OQ9C0C9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBE2OQ9C0C9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBE2OQ9C0C9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBE2OQ9C0C9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE2OQ9C0C9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE2OQ9C0C9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE2OQ9C0C9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBE2OQ9C0C9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBE2OQ9C0C9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE2OQ9C0C9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBE2OQ9C0C9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBE2OQ9C0C9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE2OQ9C0C9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE2OQ9C0C9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE2OQ9C0C9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBE2OQ9C0C9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBE2OQ9C0C9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBE2OQ9C0C9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBE2OQ9C0C9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBE2OQ9C0C9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
UBE2OQ9C0C9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBE2OQ9C0C9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBE2OQ9C0C9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
UBE2OQ9C0C9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBE2OQ9C0C9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBE2OQ9C0C9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBE2OQ9C0C9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBE2OQ9C0C9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE2OQ9C0C9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE2OQ9C0C9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE2OQ9C0C9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE2OQ9C0C9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
UBE2OQ9C0C9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBE2OQ9C0C9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBE2OQ9C0C9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBE2OQ9C0C9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBE2OQ9C0C9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBE2OQ9C0C9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
UBE2OQ9C0C9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBE2OQ9C0C9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBE2OQ9C0C9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBE2OQ9C0C9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBE2OQ9C0C9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBE2OQ9C0C9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBE2OQ9C0C9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
UBE2OQ9C0C9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
UBE2OQ9C0C9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE2OQ9C0C9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE2OQ9C0C9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBE2OQ9C0C9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
UBE2OQ9C0C9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBE2OQ9C0C9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBE2OQ9C0C9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms