Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GDF15Q99988 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GDF15Q99988 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GDF15Q99988 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GDF15Q99988 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GDF15Q99988 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GDF15Q99988 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GDF15Q99988 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GDF15Q99988 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GDF15Q99988 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GDF15Q99988 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GDF15Q99988 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GDF15Q99988 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GDF15Q99988 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GDF15Q99988 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GDF15Q99988 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GDF15Q99988 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GDF15Q99988 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GDF15Q99988 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GDF15Q99988 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GDF15Q99988 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GDF15Q99988 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GDF15Q99988 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GDF15Q99988 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GDF15Q99988 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GDF15Q99988 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GDF15Q99988 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GDF15Q99988 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GDF15Q99988 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GDF15Q99988 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GDF15Q99988 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GDF15Q99988 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GDF15Q99988 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GDF15Q99988 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GDF15Q99988 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GDF15Q99988 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GDF15Q99988 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GDF15Q99988 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GDF15Q99988 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GDF15Q99988 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GDF15Q99988 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GDF15Q99988 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GDF15Q99988 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GDF15Q99988 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GDF15Q99988 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GDF15Q99988 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GDF15Q99988 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GDF15Q99988 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GDF15Q99988 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GDF15Q99988 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GDF15Q99988 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GDF15Q99988 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GDF15Q99988 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GDF15Q99988 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GDF15Q99988 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GDF15Q99988 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GDF15Q99988 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GDF15Q99988 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GDF15Q99988 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GDF15Q99988 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GDF15Q99988 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GDF15Q99988 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GDF15Q99988 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GDF15Q99988 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GDF15Q99988 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GDF15Q99988 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GDF15Q99988 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GDF15Q99988 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GDF15Q99988 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GDF15Q99988 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GDF15Q99988 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GDF15Q99988 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GDF15Q99988 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GDF15Q99988 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GDF15Q99988 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GDF15Q99988 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GDF15Q99988 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GDF15Q99988 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GDF15Q99988 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GDF15Q99988 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GDF15Q99988 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GDF15Q99988 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GDF15Q99988 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GDF15Q99988 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GDF15Q99988 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GDF15Q99988 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GDF15Q99988 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GDF15Q99988 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GDF15Q99988 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GDF15Q99988 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GDF15Q99988 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GDF15Q99988 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GDF15Q99988 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GDF15Q99988 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GDF15Q99988 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GDF15Q99988 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GDF15Q99988 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GDF15Q99988 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GDF15Q99988 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GDF15Q99988 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms