Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIGMAR1Q99720 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIGMAR1Q99720 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIGMAR1Q99720 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIGMAR1Q99720 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIGMAR1Q99720 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIGMAR1Q99720 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIGMAR1Q99720 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIGMAR1Q99720 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIGMAR1Q99720 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIGMAR1Q99720 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SIGMAR1Q99720 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIGMAR1Q99720 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIGMAR1Q99720 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIGMAR1Q99720 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIGMAR1Q99720 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIGMAR1Q99720 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIGMAR1Q99720 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIGMAR1Q99720 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIGMAR1Q99720 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 539.1 ms