Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MTRQ99707 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MTRQ99707 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MTRQ99707 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MTRQ99707 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MTRQ99707 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MTRQ99707 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MTRQ99707 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MTRQ99707 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MTRQ99707 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MTRQ99707 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MTRQ99707 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MTRQ99707 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MTRQ99707 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MTRQ99707 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MTRQ99707 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MTRQ99707 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MTRQ99707 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MTRQ99707 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MTRQ99707 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MTRQ99707 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MTRQ99707 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MTRQ99707 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MTRQ99707 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MTRQ99707 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MTRQ99707 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MTRQ99707 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MTRQ99707 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTRQ99707 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTRQ99707 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTRQ99707 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTRQ99707 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MTRQ99707 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MTRQ99707 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MTRQ99707 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MTRQ99707 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTRQ99707 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTRQ99707 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTRQ99707 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTRQ99707 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
MTRQ99707 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MTRQ99707 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MTRQ99707 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MTRQ99707 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MTRQ99707 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MTRQ99707 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MTRQ99707 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MTRQ99707 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MTRQ99707 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MTRQ99707 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MTRQ99707 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MTRQ99707 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MTRQ99707 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MTRQ99707 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MTRQ99707 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MTRQ99707 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MTRQ99707 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTRQ99707 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTRQ99707 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTRQ99707 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTRQ99707 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTRQ99707 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MTRQ99707 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MTRQ99707 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
MTRQ99707 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MTRQ99707 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MTRQ99707 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MTRQ99707 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MTRQ99707 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MTRQ99707 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MTRQ99707 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MTRQ99707 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MTRQ99707 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MTRQ99707 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
MTRQ99707 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MTRQ99707 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MTRQ99707 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MTRQ99707 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MTRQ99707 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MTRQ99707 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MTRQ99707 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MTRQ99707 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MTRQ99707 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MTRQ99707 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MTRQ99707 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MTRQ99707 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MTRQ99707 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MTRQ99707 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MTRQ99707 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MTRQ99707 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MTRQ99707 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MTRQ99707 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MTRQ99707 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MTRQ99707 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MTRQ99707 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MTRQ99707 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MTRQ99707 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MTRQ99707 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MTRQ99707 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MTRQ99707 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms