Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHOX2BQ99453 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHOX2BQ99453 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHOX2BQ99453 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHOX2BQ99453 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHOX2BQ99453 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHOX2BQ99453 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHOX2BQ99453 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHOX2BQ99453 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHOX2BQ99453 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHOX2BQ99453 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHOX2BQ99453 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHOX2BQ99453 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHOX2BQ99453 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHOX2BQ99453 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PHOX2BQ99453 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PHOX2BQ99453 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHOX2BQ99453 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHOX2BQ99453 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHOX2BQ99453 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHOX2BQ99453 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHOX2BQ99453 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHOX2BQ99453 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHOX2BQ99453 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHOX2BQ99453 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHOX2BQ99453 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHOX2BQ99453 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHOX2BQ99453 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PHOX2BQ99453 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHOX2BQ99453 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHOX2BQ99453 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PHOX2BQ99453 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PHOX2BQ99453 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHOX2BQ99453 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHOX2BQ99453 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHOX2BQ99453 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHOX2BQ99453 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHOX2BQ99453 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHOX2BQ99453 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PHOX2BQ99453 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHOX2BQ99453 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHOX2BQ99453 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHOX2BQ99453 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHOX2BQ99453 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHOX2BQ99453 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHOX2BQ99453 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHOX2BQ99453 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHOX2BQ99453 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHOX2BQ99453 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHOX2BQ99453 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHOX2BQ99453 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHOX2BQ99453 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHOX2BQ99453 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms